ASGDeveloper 
Минифи пересоздаются только тогда когда в стилях/шаблонах/скриптах были какие либо изменения. 
Если у вас создаются каждый раз Минифи  значит ваша система работает в режиме DEVELOPMENT - по умолчанию этот режим установлен в бета версии.
создаются заново так как в режиме DEVELOPMENT
      
// Auto cleanup if MONSTRA_DEBUG is true
if (Core::$environment == Core::DEVELOPMENT) {
    // Cleanup minify                               
    if (count($files = File::scan(MINIFY, array('css', 'js', 'php'))) > 0) 
         foreach ($files as $file) File::delete(MINIFY . DS . $file);
    // Cleanup cache
    if (count($namespaces = Dir::scan(CACHE)) > 0)
         foreach ($namespaces as $namespace) Dir::delete(CACHE . DS . $namespace);
}
Режим можно менять в /monstra/bootstrap.php
Для разработки
Core::$environment = Core::DEVELOPMENT; 
Для живого сайта
Core::$environment = Core::PRODUCTION;